Bram Bakker werd op 29 oktober 1963 geboren in Zwolle.

Hij studeerde vanaf 1982 geneeskunde in Amsterdam. Na zijn registratie als basisarts (1991) werkte hij een tijd als behandelaar van transseksuelen in het VU Medisch Centrum. Daarna begon hij de opleiding tot psychiater in de Valeriuskliniek in Amsterdam.
Hij combineerde deze opleiding met promotieonderzoek.
Na zijn registratie als psychiater (1999) werkte hij enige tijd als consultant voor farmaceutische bedrijven. Hij promoveerde in 2000 op een onderzoek naar de uitkomsten van behandeling van paniekstoornis ('hyperventilatie') met pillen of praten (Psychological and pharmacological treatment in panic disorder).
Werkte als psychiater op zeer uiteenlopende plekken, en deed onderzoek aan Yale University in de Verenigde Staten. Van eind 2000 tot en met 2003 werkte hij op de afdeling psychiatrie van het Sint Lucas Andreas Ziekenhuis in Amsterdam.

In de jaren na zijn promotie begon Bram Bakker steeds meer te schrijven voor niet-professionele tijdschriften en kranten, zoals Psychologie Magazine, Vrij Nederland en Het Parool. Wel overwegend over onderwerpen die verband houden met de psyche.
Hij schreef enkele jaren met regelmaat boekrecensies in het Maandblad Geestelijke volksgezondheid (MGv), ook over fictief proza.

Begin 2003 baarde hij opzien met Te gek om los te lopen, een zeer kritisch boek over de psychiatrie en de organisatie daarvan in Nederland. Het boek was een groot succes bij patiënten en media, en verkocht zeer goed. Collega's waren 'not amused'.
In 2004 verscheen een tweede boek, Loden last, dat hij schreef met de schrijver/journalist Bram Hulzebos. Het gaat over de ellende die door zelfmoord wordt veroorzaakt.
Ook dit boek kreeg zeer veel media-aandacht.
In 2005 verscheen de opvolger van Te gek: Te zot voor woorden. In dit boek gaat Bram Bakker nader in op de (on)mogelijkheden van de hedendaagse psychiatrie. In 2008 zijn Te gek en Te zot gebundeld in een Rainbow-pocket onder de titel Cowboy in de psychiatrie.

In 2006 volgde een wel heel persoonlijk boek: De halve van Egmond. Liever een marathon dan een burnout. Hierin aandacht voor het effect van harlopen op de psyche, afgewisseld met persoonlijke ervaringen met hardlopen en marathons. Ook dit boek beleefde meerdere drukken en het verscheen in een tientjeseditie.
Met fysiotherapeut Simon van Woerkom werkte Bram Bakker aan het boek Runningtherapie, dat november 2008 verscheen. Hierin een pleidooi gericht aan artsen en patiënten om runningtherapie te gebruiken als behandelalternatief voor pillen.

Columns van zijn hand verschijnen in het Algemeen Dagblad en Revu. Een bundeling van columns verscheen onder de titel De dwarse psychiater.

Na drie jaar in deeltijd gewerkt te hebben op de Ursula, het landelijke kennis- en behandelcentrum voor eetstoornissen in Leidschendam, in combinatie met een kleine eigen praktijk, werkt Bram Bakker thans drie dagen per week voor een GGZ-instelling.
De rest van zijn werktijd besteedt hij aan Boekestijn & Bakker Coaching en schrijven.
Daarnaast interviewt hij Nederlandse schrijvers voor publiek - zie Literatuurindeduinen.nl - en begeleidt hij topsporters.

Bram Bakker heeft ondertussen meer dan dertig marathons gelopen. Als hardloper is hij lid van de Nederlandse Centurions. Als mental coach van topsporters is hij lid van de VSPN (Vereniging Sportpsychologie Nederland).

Bram Bakker woont samen en heeft twee zoons en een dochter.